ראשיתו של המשכן לאמנות ב- 1937 ב"פינת אמנות" בצריף עץ קטן באטלייה של האמן המקומי חיים אתר (1953-1902), יוזם המוזיאון ומייסדו. בשנת 1948 נפתח חלקו הראשון של מבנה הקבע שכונה מעתה: משכן לאמנות.
אוספי המוזיאון כוללים פריטי יודאיקה מקהילות ישראל ממזרח וממערב ויצירות אמנות מהמאה ה-19 עד לימינו בתחומי הפיסול, הציור, הגרפיקה והצילום. תכנית הפעילות של המוזיאון כוללת תערוכות מתחלפות המלוות בהוצאה לאור של ספרים וקטלוגים. לעתים מתקיימים במסגרת התערוכה אירועים, סימפוזיונים וימי עיון בהשתתפות אנשי אמנות ואקדמיה מהמובילים בארץ ובעולם.
האדריכל שמואל ביקלס (1909-1975) תכנן יצירה ארכיטקטונית מופלאה בפשטותה, שאיכותה ביחסי המידות של האולמות ובניצול המקורי והיחודי של האור הטבעי. בבנין רחב הידיים נבנו בהדרגה 14 אולמות תצוגה, חצרות לפסלים, ספרייה וסדנאות. בשנים האחרונות שופצו ונבנו חלל כניסה, מחסן וסדנה ע"י משרד אדריכלים עדה כרמי-מלמד.