קואופרטיב דן נוסד ב-1 בדצמבר 1945, עם איחודם של שני קואופרטיבים - 'המעביר' ו'איחוד רגב'. 'המעביר' נוסד בשנת 1928 עם איחודן של אגודות הנהגים 'המעביר' ו'גלי אביב' ופעל בתל-אביב. 'איחוד רגב' נוסד בשנת 1931 עם איחודן של האגודות 'האיחוד', 'הברק' ו'רגב' ופעל ברמת גן, גבעתיים, בני ברק ופתח תקווה. ביום הקמתו מנה קואופרטיב 'דן' 459 נהגים ו-223 אוטובוסים. כלי הרכב הראשונים של החברה היו משאיות של הצבא הבריטי, שהוסבו לאוטובוסים. בהמשך נרכשו אוטובוסים מתוצרת ארצות הברית, צרפת ובריטניה.

לאחר קום המדינה, בעקבות קליטת העליה ההמונית של שנות החמישים, התרחבה פעילותו של הקואופרטיב באופן משמעותי: הצטרפו חברים חדשים לקואופרטיב, נרכשו אוטובוסים חדשים, נוספו קווים חדשים והוארכו קווים קיימים בהתאם להתרחבות הישוב העירוני בגוש דן.

החברה פעלה בתחילה בתל אביב, רמת גן, בני ברק, גבעתיים, פתח תקווה, קריית אונו ואור יהודה. בהדרגה הורחבה הפעילות לראש העין, יהוד, בת ים, דרום השרון ומעט בחולון ובראשון לציון. החל משנות ה-80 פעלה החברה גם ביהודה ושומרון. שנים רבות פעלה החברה כמונופול בתחום תחבורת האוטובוסים בגוש דן. בשנות האלפים, במסגרת מדיניות ממשלתית של ביזור ההפעלה של התחבורה הציבורית, הועברו רוב קווי פתח תקווה ובקעת אונו לחברת 'קווים'. 'דן' מפעילה גם קווים מבני ברק לירושלים.

מאז הקמתו היה 'דן' קואופרטיב, כלומר, חברה בבעלות עובדיה. במטרה להתאים את הארגון למגמות המשתנות בתחום התחבורה הציבורית וכדי להתייעל ולשפר את השירות לציבור, הוחלט באסיפת החברים (בעלי המניות) לבצע שינוי מבני יסודי ולהפוך את 'דן' לחברה בע"מ. לאחר קבלת אישורים מכל הרשויות נכנס השינוי לתוקף, והחל ממאי 2002 נקראת החברה: 'דן חברה לתחבורה ציבורית בע"מ'.

כיום מועסקים ב'דן' כ-2400 עובדים (מהם כ-830 בעלי מניות). מדי חודש מובילים אוטובוסי 'דן' מעל 14 מיליון נוסעים (כ-640 אלף ביום).